يعتمد سبب عسر الطمث على نوعية عسر الطمث الاولى له علاقة بعدم التوازن بين المواد الكيمياويه المنظمه والمنبهة لتقلصات عضلة الرحم وبشكل خاص البروستاغلاندين والحمض الاراكييدوني ( الأراشيدوني ) أما أسباب عسر الطمث الثانوي فمتعلقة بالاصابه بحالات مرضيه أو غير ذلك بطانة الرحم الهاجره والتهابات منطقة الحوض والألياف الرحمية والحمل الغير مثل الحمل داخل الانبوب او الاحهاض و الامراض التي تنتقل عن طريق الا تصال الجنسي و أكياس المبيض والمبايض المتعددة الاكياس