أهم ما في هذه المرحلة هو الاكتشاف المبكر لالتهاب الحلق واللوزتين وللبكتريا المسببة للحمى الروماتيزمية وعلاجها بالمضاد الحيوي. وإن زراعة مسحة الحلق واللوزتين أهم دليل على إثبات وجود البكتريا، أما الوقاية الثانوية، فتتمثل في منع تكرار الإصابة بالحمى الروماتزمية؛ وذلك بمنع الالتهابات البكتيرية للحلق واللوزتين، ويتطلب هذا النوع من الوقاية إلى استخدام مضاد حيوي هو(البنسلين) كل شهر باستمرار، وذلك بأخذ حقنة في العضل كل 4 أسابيع، التي تعمل على تطهير الحلق واللوزتين من هذه البكتريا لمدة أشهر، ويمكن أخذ أنواع أخرى من المضادات الحيوية غير البنسلين في حالة وجود حساسية من البنسلين