بعد زرع النخاع العظمي، فإن المريض يتلقى العلاج المضاد لجهاز المناعة عنده، وذلك لمنع رفض الطعم. هذه العلاجات صعبة نسبيا، وتسبب في ضعف شديد وتثبيط مناعة المريض، مما يجعله أكثر عرضة للإصابة بالملوثات المختلفة. العزلة في المستشفى بعد عملية الزرع هي غالبا ما تكون السبيل الوحيد للحد قدر الإمكان من إصابة المريض بالملوثات، الموجودة على نحو كبير في المستشفى، والتي يمكن أن تسبب الأمراض والوفيات بعد عملية الزرع. لهذا السبب، يوصى المريض بعدم مغادرة غرفته كثيرا، وأن يقوم الطاقم الطبي باتخاذ الاحتياطات اللازمة لتجنب العدوى، بما في ذلك ارتداء قناع، ثوب وقفازات، في كل مرة يقترب فيها من المريض.