احتلت جامعة أسيوط مركزاً متميزاً بين الجامعات المصرية والعالمية وذلك وفقاً لما نشر في  موقع ويبميتركس الأسباني لتصنيف الجامعات في يوليو 2013 والذى يقوم بتقييم أكثر من 12 ألف جامعة على مستوى العالم . وقد جاءت جامعة أسيوط في المركز الخامس بين أفضل الجامعات المصرية بعد جامعة القاهرة، والجامعة الأمريكية بالقاهرة، ثم المنصورة، وعين شمس . كما احتلت مركزاً متميزاً بين أفضل الجامعات على مستوى الدول العربية وكذلك على مستوى قارة إفريقيا حيث جاءت جامعة أسيوط فى  المركز الخامس عشر بين الجامعات العربية والمركز التاسع عشر إفريقياً ، أما على مستوى جامعات العالم فقد جاءت جامعة أسيوط فى المركز رقم 1924 . يذكر أن ويبميتركس يعتمد في تصنيفه على الموقع الإلكتروني للجامعات، وخاصة في حجم المحتويات والرؤية بالإضافة إلى أثر هذه المنشورات على شبكة الانترنت وذلك وفقاً لعدد من المواقع الخارجية التي يتم تحليلها وفقاً لأبحاث المجلس الوطني للبحوث الإسبانية بمدريد.